Wśród przyczyn niskich przepływów na odcinku do ujścia Nysy Łużyckiej wymienia się także budowę geologiczną terenów, złożonych z czwartorzędowych utworów piaszczystych. Na szlaku od Brzegu Dolnego do Ścinawy około 15% przepływów traconych jest w wyniku przesiąków w głąb koryta rzeki . Ogółem, jak wspominano wcześniej, Odra wykazuje się niskimi przepływami w zestawieniu z innymi europejskimi rzekami podobnej długości: jej średnie przepływy stanowią tylko 50% przepływu w Łabie i mniej niż 25% przepływu w Renie. Tym więcej wysiłku należy włożyć dla doprowadzenia rzeki do stanu technicznego zapewniającego ekonomiczne wykorzystanie transportowe.
Odcinek od Brzegu Dolnego do ujścia Nysy Łużyckiej jest kluczowy z punktu widzenia spójności szlaku wodnego Odry i komunikacji wodnej regionów położonych nad górną i środkową Odrą (w tym województwa dolnośląskiego) z portem Szczecin oraz z drogami wodnymi zachodniej Europy. Powinien on być przedmiotem szczególnego zaangażowania inwestycyjnego. W chwili obecnej w ramach Programu dla Odry 2006 w km 300 Odry trwa budowa stopnia wodnego Malczyce, który wydłuży odcinek skanalizowany i poprawi do pewnego stopnia warunki żeglugi na Odrze swobodnie płynącej. Ponadto Program dla Odry 2006 przewiduje prace w zakresie odmulania koryta rzeki i naprawy budowli regulacyjnych, głównie ostróg.
